Юсупов Рафаэль Мидхатович родился 17 июля 1934 года в г. Казани. После окончания с золотой медалью Казанской спецшколы ВВС поступил в Ленинградскую военно-воздушную инженерную академию имени А.Ф. Можайского (ныне Военно-космическая академия имени А.Ф. Можайского), которую окончил с отличием в 1958 году. В 1964 году окончил Ленинградский госуниверситет по специальности «математик». До 1989 года проходил службу в Военной академии имени А.Ф. Можайского в должностях от инженера до начальника кафедры, начальника факультета сбора и обработки информации за исключением 1985-1986 гг., когда проходил службу в Генштабе ВС СССР в должности начальника направления моделирования стратегических операций. С 1989 по 1991 год заместитель директора Санкт-Петербургского института информатики и автоматизации РАН (СПИИРАН) по научной работе. С 1991 года по настоящее время – директор СПИИРАН.
Юсупов Рафаэль Мидхатович – выдающийся ученый в области информатики, информационных технологий и теории управления, основатель и руководитель научных школ по теоретическим основам информатизации общества и по теории чувствительности сложных информационно-управляющих систем. Благодаря работам Р.М. Юсупова анализ чувствительности стал обязательным этапом проектирования информационных систем, систем управления и высокоточных устройств.
С его именем и трудами связано также развитие таких новых научных направлений как геофизическая кибернетика, квалиметрия моделей, информационная безопасность.
Последние 25 лет Р.М. Юсуповым развиваются теоретические основы информатики, информатизации и информационного общества.
Значительные результаты, полученные им при разработке концептуальных и методологических основ информатизации и информационного общества, оказали существенное влияние на эти процессы в Санкт-Петербурге и стране.
Полученные Р.М. Юсуповым научные результаты использованы в следующих концептуальных документах, подготовленных с его непосредственным участием: Обобщенная концепция информатизации Ленинградского экономического региона (1991 г.); Концепция информатизации Санкт-Петербурга (Программа социально-экономического развития Санкт-Петербурга на период до 2000 года) (1994 г.); Стратегический план Санкт-Петербурга: Приложения 14 и 17. Материалы тематических комиссий «Телекоммуникации и информатизация» и «Безопасность» (1998 г.); Концепция «Стратегия перехода Санкт-Петербурга к информационному обществу» (1999 г.); Проект целевой программы «Электронный Санкт-Петербург (2003-2007 гг.)» (2003 г.); Модельный закон для СНГ «Об информатизации, информации и защите информации» (2005 г.); Программа развития информационного общества в Санкт-Петербурге и план мероприятий по реализации Стратегии развития информационного общества в Санкт-Петербурге на 2009-2015 годы (2008 г.); Модельный закон для СНГ «Об электронной торговле» (2008 г.) и др.
Р.М. Юсупов – бессменный председатель оргкомитета конференций, проводимых в городе на регулярной основе при поддержке Правительства Санкт-Петербурга: «Региональная информатика» (1991-2016) и «Информационная безопасность регионов России» (1999-2015), которые способствуют формированию единого информационного пространства и информационно-образовательной среды города. Благодаря его усилиям, руководимый им институт стал научно-методическим центром информатизации Санкт-Петербурга.
Профессор Р.М. Юсупов активно участвует в подготовке инженерных и научных кадров высшей квалификации. Он является инициатором создания шести базовых кафедр в ведущих университетах Санкт-Петербурга.
Р.М. Юсуповым подготовлено 11 докторов наук и 46 кандидатов наук, он является автором более 400 научных трудов, в том числе 20 монографий и 17 изобретений.
Р.М. Юсупов является почетным доктором Петрозаводского государственного университета, Санкт-петербургского университета управления и экономики, почетным профессором Военно-космической академии имени А.Ф. Можайского, почетным академиком Академии наук Республики Татарстан.
Р.М. Юсупов ведет большую научно-организаторскую и общественную работу, являясь членом Научного совета при Совете безопасности РФ (1999-2014), членом Президиума Санкт-Петербургского научного Центра Российской академии наук (СПбНЦ РАН), председателем Объединенного Научного Совета по информатике, телекоммуникациям и управлению при Президиуме СПбНЦ РАН, заместителем председателя Научного совета по информатизации Санкт-Петербурга, членом Северо-Западной секции содействия развитию экономической науки Российской академии наук, членом бюро Отделения нанотехнологий и информационных технологий Российской академии наук, президентом Национального общества имитационного моделирования и членом других научных обществ и советов. В 2000-2008 гг. Р.М. Юсупов был членом Общественного совета Санкт-Петербурга, в настоящее время является членом Общественного совета Комитета по информатизации и связи Правительства Санкт-Петербурга.
По его инициативе в здании института в 1995 году создан музей всемирно известной гимназии Карла Мая, пропагандирующий лучшие педагогические и культурно-нравственные традиции российской школы и науки.
За высокие достижения в научной, педагогической и общественной деятельности Р.М. Юсупов награжден орденом «Красной звезды» (1978 г.), орденом «Почета» (1999 г.), орденом «За заслуги перед Отечеством» IV степени (2005 г.), ему присвоено почетное звание «Заслуженный деятель науки и техники РФ» (1984 г.) и «Почетный радист СССР» (1974 г.), лауреат премии Правительства Российской Федерации 2009 года в области образования.
Благодаря усилиям Р.М. Юсупова как директора института, которым он руководит 27 лет, в сложных условиях социально-экономических реформ удалось не только сохранить и увеличить основной интеллектуальный потенциал института, но и закрепить за институтом роль одного из ведущих научных учреждений в области информатики и автоматизации в Санкт-Петербурге и в Отделении нанотехнологий и информационных технологий Российской академии наук.